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13组被删除基因序列寻回 或助深挖新冠疫情源头




来源: (星岛日报 )    2021/6/27 18:06:52
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布鲁姆是在阅读其他研究人员撰写的一篇分析想要寻找那些基因序列时,才发现它们已从NIH的“序列阅读档案库”被删除的。发现此事后,布鲁姆用了数天时间在互联网上搜索,最终寻回了被删除的部分序列。

综合《华尔街日报》、《纽约时报》和《华盛顿邮报》报道,布鲁姆在审查不同研究组织发表的资料时,发现了2020年3月的一份电子表格,其中包含241个武汉大学的科学家采集的新冠病毒基因序列,电子表格显示,中国科学家将序列上传到美国政府的国家医学图书馆的“序列阅读档案库”,但当他在本月较早寻找这些序列时,结果却是“无法找到”。

他在不解之下返回电子图表寻找更多线索,发现241个序列是被武汉人民医院一位名叫傅艾思(Aisi Fu,音译)的科学家采集的,通过搜索医疗文献,布鲁姆最终找到2020年3月傅艾思和同事在网上贴出的另一项研究,讲述检测新冠病毒的一个新方法,他们3个月后在一家科学期刊上发表这一成果。

论文中写到,他们研究了疫情早期从疑似感染病毒的门诊病人那里获得的鼻咽拭子病毒样本,寻找可能的新冠病毒基因物质。他们没有公布他们在那些样本中实际获得的基因序列,但一些线索让布鲁姆意识到,这些样本就是被删除的241个基因序列。

布鲁姆经过搜索,发现这些序列很多储存在谷歌云端平台,并从那里寻回了13个序列。

获得这些序列后,布鲁姆将它们和更早从华南海鲜市场获得的样本进行比较,发现从海鲜市场的病毒样本增加了3个变异,但在后来采集的样本中却没有这种变异,这似乎支持了新冠病毒没有经过海鲜市场的观点,暗示新冠病毒在海鲜市场出现前,已经在武汉或其他地区传播了一段时间的看法。

布鲁姆说,从之前排序得知的武汉早期出现的情况可能有偏差。布鲁姆承认他的这个结论还需对病毒序列做进一步的分析。

亚利桑那大学进化生物学家沃罗贝(Michael Worobey)表示,布鲁姆的论文是杰出的调查报告,将会极大推进对新冠病毒起源的了解。沃罗贝目前正和同事对新冠病毒基因开展一项大规模研究,以便更好地了解病毒起源,他们将会把布鲁姆找回的13个序列加入研究中。



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